Santo Domingo Xagacía es uno de los 570 municipios del estado de Oaxaca. Colinda al norte con los municipios de Santiago Laxopa, San Pedro Cajones y San Francisco Cajonos; al este con los municipios de San Francisco Cajones y San Pablo Yaganiza; al sur con los municipios de San Pablo Yaganiza, Santo Domingo Albarradas y Villa Díaz Ordaz; al oeste con los municipios de Villa Díaz Ordaz y Santiago Laxopa. El clima es templado húmedo con abundantes lluvias en verano (89.62%), semicálido húmedo con abundantes lluvias en verano (9.87%) y semifrío húmedo con abundantes lluvias en verano (0.51%).

En 2020, la población en Santo Domingo Xagacía fue de 1,205 habitantes (46% hombres y 54% mujeres). La población de 3 años y más que habla al menos una lengua indígena fue 922 personas, lo que corresponde a 76.5% del total de la población de Santo Domingo Xagacía. Las lenguas indígenas más habladas fueron Zapoteco (910 habitantes), Mixe (7 habitantes) y Totonaco (2 habitantes).